聖保祿學校學生會由幼稚園部學生會、小學部學生會及中學部學生會組成，多年來一直致力建立學生與學校之間的溝通橋樑，提供福利及舉辦各種活動，豐富學生的校園生活。自本校於2001年實行「E.S.O.S.」計劃，其中的重要理念—「賦權學生」，給予了學生會同學更多的權力。
本校於幼稚園階段便開始設立學生會，至今已成立十逾年。成員有機會負責擔任校內活動司儀、接待外來參觀的嘉賓等工作，讓學生從小培養團隊精神、領袖能力、建立自信心和訓練口才，讓學生的成長得到更全面的發展。
而小學部學生會至今已成立二十一年，多年來皆會舉辦親子活動給小學部各級家長和學生參與、舉辦大型創意比賽、營運小賣部、擔任校內活動司儀、接待外來參觀的嘉賓等工作，使參與學生會工作的學生能初步學習及獲得舉辦活動的能力、加強團體合作精神、建立自信心和訓練口才。
中學部學生會至今已成立二十四年，每年舉辦不同類型活動讓學生參與，如歌唱比賽、城市定向、體育比賽等，多元化的活動發展讓更多同學接觸不同領域；另外，中學學生會亦會致力為學生爭取福利，建立學校與學生之間良好的溝通橋樑。此外，參與學生會工作能提升學生自身的活動策劃、人際交往及問題解難等多方面技能，更能為日後踏入社會作準備。
小學及中學部的正副會長亦會代表出席學校行政會議，會上為學生們表達意見、爭取權益，讓學生擁有參與學校事務的機會。而中、小學生會會長每年均由該學部全體同學票選，讓學生能初步認識投票的意義，亦會舉行政綱發佈會，使學生的成長得到更全面的發展。
